Doanh nghiệp phải nộp báo cáo tài chính ở đâu? Hướng dẫn chi tiết theo quy định mới 2026

Từ 01/01/2026, Thông tư 99/2025/TT-BTC, đã quy định rõ ràng nơi nộp báo cáo tài chính và yêu cầu về đính kèm báo cáo kiểm toán. Đồng thời quy định thời hạn nộp báo cáo tài chính chặt chẽ, chậm nhất 90 ngày kể từ ngày kết thúc kỳ kế toán năm. Những thay đổi này buộc doanh nghiệp phải rà soát ngay quy trình nộp báo cáo tài chính để tránh rủi ro pháp lý và mất uy tín.

Vì sao “nơi nộp báo cáo tài chính” bỗng trở nên quan trọng?

Từ trước đến nay, doanh nghiệp vẫn nộp báo cáo tài chính cho nhiều cơ quan: cơ quan thuế, cơ quan đăng ký doanh nghiệp. Sở Kế hoạch & Đầu tư, Bộ/Ngành liên quan… Tuy nhiên, Thông tư 99/2025/TT-BTC cụ thể hóa trách nhiệm nộp báo cáo tài chính. Và quy định thêm về trường hợp báo cáo tài chính, được lưu trên hệ thống thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp. Khi đó cơ quan nhận, có thể tra cứu hoặc yêu cầu đơn vị cung cấp trích xuất. Việc này làm rõ “nơi nộp” theo hướng tập trung vào thủ tục hành chính đúng luật, tránh nộp sai nơi, sai hình thức

Nơi nhận Báo cáo tài chính 

• Việc nộp Báo cáo tài chính cho cơ quan có thẩm quyền phải tuân theo quy định của pháp luật liên quan.

• Đối với doanh nghiệp buộc phải kiểm toán, khi nộp báo cáo cho cơ quan có thẩm quyền phải đính kèm báo cáo kiểm toán.

• Trường hợp báo cáo được lưu giữ tại Hệ thống thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp, các cơ quan nhận có quyền yêu cầu cung cấp thông tin theo quy định.

Thời hạn nộp Báo cáo tài chính

Báo cáo tài chính năm, doanh nghiệp phải nộp chậm nhất 90 ngày kể từ ngày kết thúc kỳ kế toán năm. Ví dụ: nếu kỳ kết thúc ngày 31/12/2026 thì hạn nộp là 31/03/2027. Trường hợp doanh nghiệp, là công ty mẹ hoặc tổng công ty thì có quyền quy định thời hạn nội bộ cho các công ty con. Hoặc đơn vị trực thuộc để gửi báo cáo cho công ty mẹ, nhằm phục vụ việc hợp nhất hoặc tổng hợp báo cáo tài chính. Nhưng phải phù hợp, với quy định của pháp luật và yêu cầu quản lý của đơn vị. Các báo cáo theo kỳ khác (quý, bán niên) thực hiện theo quy định pháp luật liên quan.

Cơ quan có thẩm quyền nhận báo cáo tài chính

Từ 01/01/2026, theo Điều 26 Thông tư 99/2025/TT-BTC, việc nộp báo cáo tài chính (BCTC). Phải thực hiện đúng cơ quan có thẩm quyền theo quy định pháp luật. Cụ thể:

Doanh nghiệp phải nộp báo cáo tài chính cho cơ quan nào?

• Cơ quan quản lý nhà nước theo pháp luật liên quan:

  Mỗi loại hình doanh nghiệp sẽ có cơ quan nhận khác nhau, ví dụ: Sở Kế hoạch & Đầu tư / Phòng Đăng ký kinh doanh đối với doanh nghiệp phải đăng ký hoặc lưu trữ BCTC tại hệ thống đăng ký doanh nghiệp.

• Cơ quan thuế:

  Nếu doanh nghiệp thuộc diện quản lý thuế, cần nộp hồ sơ BCTC để lưu trữ, theo dõi nghĩa vụ thuế.

• Bộ, ngành chuyên môn:

  Đối với doanh nghiệp ngành đặc thù như ngân hàng, chứng khoán, bảo hiểm. Nơi nhận có thể là cơ quan quản lý chuyên ngành theo quy định.

• Hệ thống thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp:

  Nếu BCTC được lưu trữ trên hệ thống này, các cơ quan nhà nước khác có thể yêu cầu trích xuất thông tin theo quy định pháp luật.

Lưu ý quan trọng

Doanh nghiệp mà pháp luật quy định, bắt buộc kiểm toán thì khi nộp BCTC phải kèm báo cáo kiểm toán. Việc xác định đúng, cơ quan nhận giúp doanh nghiệp tránh nộp sai nơi. Đảm bảo đúng hạn và minh bạch thông tin tài chính.

Hình thức nộp và điều kiện đính kèm báo cáo tài chính 

Theo Điều 26 Thông tư 99/2025/TT-BTC, từ 01/01/2026. Doanh nghiệp phải nộp báo cáo tài chính (BCTC) cho cơ quan có thẩm quyền. Hình thức nộp gồm:

Nộp bản giấy: nếu cơ quan yêu cầu hoặc quy định pháp luật bắt buộc.

Nộp điện tử: qua hệ thống của cơ quan quản lý, hoặc đăng tải lên Hệ thống thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp nếu được phép.

Kết hợp: doanh nghiệp có thể, vừa nộp bản điện tử cho cơ quan có thẩm quyền, vừa công khai trên website hoặc lưu trữ nội bộ để minh bạch thông tin.

Yêu cầu đính kèm báo cáo kiểm toán

Nếu doanh nghiệp thuộc diện bắt buộc kiểm toán, khi nộp BCTC phải đính kèm báo cáo kiểm toán độc lập theo quy định của pháp luật. Đây là yêu cầu bắt buộc để cơ quan có thẩm quyền nhận báo cáo tài chính, đảm bảo dữ liệu chính xác và minh bạch.

Nếu BCTC đã được lưu giữ trên Hệ thống thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp, các cơ quan nhận báo cáo có quyền yêu cầu trích xuất thông tin để tra cứu theo quy định.

Doanh nghiệp cần chọn đúng hình thức nộp và đính kèm đầy đủ. Để tránh bị trả lại hồ sơ hoặc vi phạm thời hạn nộp.

Vì sao “báo cáo tài chính” lại gấp rút tới vậy?

Rủi ro nếu doanh nghiệp chậm trễ:

Vi phạm thời hạn nộp, hoặc nộp sai nơi nhận có thể bị xử phạt hành chính. Hoặc bị “chê” trong hồ sơ tín dụng, đầu tư, đấu thầu. Thiếu minh bạch báo cáo tài chính làm mất niềm tin với đối tác, nhà cung cấp, nhà đầu tư,… Ảnh hưởng trực tiếp tới hoạt động kinh doanh. Quy định mới từ 2026 tăng mức độ kiểm soát, chuẩn hóa số liệu và cách trình bày. Doanh nghiệp không chuẩn bị sẽ bị áp lực về hệ thống và chi phí sửa sai.

Cơ hội cho doanh nghiệp hành động trước:

Doanh nghiệp đi trước phần còn lại về việc chuẩn bị báo cáo tài chính đúng quy định sẽ có lợi thế cạnh tranh: minh bạch, uy tín, dễ tiếp cận nguồn vốn, hợp tác. Hệ thống kế toán theo Thông tư 99/2025 giúp doanh nghiệp kiểm soát tài chính tốt hơn, phản ánh đúng “sức khỏe” doanh nghiệp, hỗ trợ quản trị chiến lược.

Hướng dẫn các bước để doanh nghiệp làm ngay cho báo cáo tài chính

Trước khi kết thúc kỳ kế toán năm hiện hành

1. Xác định rõ kỳ kế toán công ty bạn sử dụng: 31/12 hay khác.

2. Kiểm tra xem có thuộc đối tượng doanh nghiệp bắt buộc kiểm toán báo cáo tài chính hay không. Nếu có, chuẩn bị ngay quan hệ với đơn vị kiểm toán.

3. Chuẩn hóa hệ thống kế toán, chứng từ, sổ sách theo mẫu và nguyên tắc của Thông tư 99/2025/TT-BTC.

4. Xác định cơ quan nơi nhận báo cáo tài chính. Đăng ký doanh nghiệp, Bộ Tài chính, Sở KHĐT… và chuẩn bị nộp theo đúng nơi đó.

5. Lập kế hoạch nộp báo cáo tài chính. Tính ngược từ ngày kết thúc kỳ kế toán 90 ngày, đặt mốc chiến lược để tránh bị trễ.

Khi bắt đầu năm tài chính theo Thông tư 99 (áp dụng từ 01/01/2026)

1. Lập báo cáo tài chính năm theo mẫu mới. Đảm bảo nội dung phần tài sản, nợ phải trả, vốn chủ sở hữu, doanh thu, chi phí, dòng tiền… 

2. Xem lại nội dung “Bản thuyết minh báo cáo tài chính”. Và giải trình chính sách kế toán, số liệu so sánh, chuyển đổi nếu có ngoại tệ. 

3. Nộp báo cáo tài chính cho cơ quan có thẩm quyền đúng thời hạn và đúng nơi nhận đã xác định. Kèm theo báo cáo kiểm toán nếu bắt buộc.

4. Công khai báo cáo tài chính đăng trên website doanh nghiệp. Niêm yết tại trụ sở, gửi tới các đối tượng có quyền nhận thông tin (chủ sở hữu, chủ nợ, nhà cung cấp…).

5. Rà soát lần cuối trước, khi nộp số liệu cho khớp. Trình bày rõ ràng, lưu trữ chứng từ đầy đủ, để tránh bị “hậu kiểm” hoặc chỉnh sửa sau.

Việc lập, nộp, công khai báo cáo tài chính không còn là điều “nên làm”. Mà đã trở thành, yêu cầu bắt buộc và cấp bách từ 01/01/2026 theo Thông tư 99/2025/TT-BTC. Báo cáo tài chính, từ “gánh nặng thủ tục”. Thành công cụ quản trị & hỗ trợ phát triển doanh nghiệp. Giúp doanh nghiệp minh bạch hơn, uy tín hơn. Về khả năng kết nối, đầu tư và cạnh tranh tốt hơn…

Nếu bạn cần mẫu chứng từ, phần mềm kế toán phù hợp. Hoặc tư vấn, chi tiết theo thực trạng kinh doanh của bạn. Hãy liên hệ ngay cho Zalo GDservice Việt Nam hoặc đăng ký nhận tin ở phía dưới. 

Liên hệ tư vấn: Kiểm toán – Kế toán – Thuế – Thành lập doanh nghiệp – Visa/Giấy phép lao động